Em 1956 organiza-se na piscina do Liceu D. Manuel II um Curso de Natação regido por Rui Marques da Silva, que em 1959 é substituído pelo Dr. Ernesto Braga contratado para a secção de Natação. Em 1960 começa a Secção de Natação a utilizar também a piscina do Regimento de Artilharia Pesada n.° 2.
Durante as décadas de 70 e 80 a secção contava com diversos atletas a participar em campeonatos Regionais e Nacionais sob a alçada de diversos técnicos como os Professores Jorge Mota, Cristina Oliveira (acumulou o cargo com a Natação sincronizada).
Entre 1989 e 2012 sob a direcção do Dr Raul Monteiro a secção de natação conta com diversos técnicos a liderar a equipa, tais como os Professores João Paulo Vilas Boas, Joaquim Marques e João Monteiro que conseguem subir o CDUP do 3º ao 2⁰ escalão nacional, masculinos e femininos, na época de 1992/3 e da 2ª à 1ª divisão em masculinos 4 épocas mais tarde. Na época de 1991/92 a equipa masculina classificou-se em 6⁰ lugar absoluto nos Campeonatos Nacionais Absolutos e no ano seguinte foi 5⁰ no mesmo Campeonato.
Em termos individuais, neste período apareceram os primeiros títulos nacionais e as primeiras chamadas à Seleção Nacional por Ricardo Camacho e Miguel Machado.
A estes títulos juntaram-se muitos mais a nivel Regional e presenças em Finais de Meetings Internacionais em Portugal e no estrangeiro
A secção iniciou esta época 24/25 a competição na modalidade de Absoluto na qual já não participava desde 2012 e pretende alargar o mesmo para o sector Feminino apesar das dificuldades de captar atletas com idade inferior a 25 anos e com algum nível de competição para participar nessas provas. Acresce a isto que a secção não tem condições para uma equipa de formação pelo que os atletas que ingressam ou não tem experiência de competição ou são provenientes de outros clubes da região.
Após o desmantelamento da piscina da Boa Hora a secção tem conseguido manter-se ativa com a prática de treinos regulares dos atletas em horários livres de diversas piscinas municipais da cidade bem como na piscina da FADEUP onde se concentram grande parte dos atletas.
Ao longo dos últimos 14 anos a secção de natação tem estado presente nas competições graças à componente Master e Águas Aberta pelas mãos de ex-atletas e pessoas que já estiveram ligadas ao clube que foram e vão mantendo a presença pontual nas competições e o nome do Clube apenas nestas vertentes no que toca a competições Federadas.
Actualmente a secção conta com 50 Atletas federados nas vertentes de Natação Pura, Natação Master e Águas Abertas, competindo nos diversos campeonatos Nacionais, Regionais e Torneios obtendo resultados e pódios em todas as vertentes.
Treinos conjuntos de Absolutos, Masters e Águas Abertas nos seguintes horários:
Piscina FADEUP (Treino orientado com treinador):
2ª e 4ª das 19h às 20h30 / 3ª e 5º das 18h45 às 20h15
Piscina Constituição
2ª e 6ª das 12h às 13h (Treino disponibilizado semanalmente pelo treinador)
2ª a 6ª das 8h às 8h45 (Treino orientado pela equipa Natação da Piscina Constituição)
